在对新疆、内蒙干旱地区采集的48株苜蓿、草木樨、锦鸡儿根瘤菌进行数值分类和SDS-PAGE全细胞蛋白分析的基础上,对数值分类确立的三个亚群进行了16S rDNA-RFLP分析,在87%的相似性水平上,三个新亚群的菌株相应聚类成群.其中第2亚群属于Sinorhizobium分枝,与S.meliloti, S.fredii. S. teranga, S. Saheli在92%的相似水平上聚在一起.第3亚群则与Rhizobium处于同一分枝且与属内各已知种相互区分开,可能为一独立的种.第1亚群有可能为一独立的属,值得进一步研究.此结果进一步证实来自干旱地区的根瘤菌具有很大特异性.