应用异源双链泳动分析法快速确定(HIV-1)基因亚型

• 作者: 姚均 张峰 潘品良 苏玲 赵全壁 邢辉 邵一鸣 陈秀珠
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: HIV-1 亚型 HMA 序列测定 系统树
• 年，卷（期）: 1999,（4）
• 所属期刊栏目: 论著人与动物病毒
• 页码范围: 296-304
• 分类号: R512.91|Q78
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.1999.04.002

摘要

应用异源双链泳动分析法(Heterouduplex mobility assay,HMA),对来自我国云南、四川、新疆、浙江、广东、福建、天津7省市73份HIV感染者样品,进行了HIV-1膜蛋白(env)基因片段亚型分析.通过HMA能确定亚型的有70份,占样品总数的95.89%(70/73).其中A亚型2.86%(2/70),F亚型2.86%(2/70),泰国B亚型18.58%(13/70),欧美B亚型8.56%(6/70),C亚型38.57%(27/70),E亚型28.57%(20/70).为了检验结果的准确性和探讨3份样品不能用HMA分型的原因,进一步对样品进行序列测定和系统树分析,并将两者结果的相互比较,两者对HIV-1分型显示出高度的一致性,其亚型一致率达95.89%(70/73).而3份样品不能确定亚型的原因主要是,其env基因区段与相应的参考亚型质粒毒株相比变异太大.这提示,为了提高HMA分型的敏感性,应不断地选择代表性好的毒株构建参考亚型质粒.