12株猪瘟病毒E2基因主要抗原区域的序列差异分析

• 作者: 丘惠深 李博 王在时 王琴 赵耘
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪瘟病毒 E2基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2000,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 614-621
• 页数: 8页
• 分类号: S85
• 字数: 4371字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0001-6209.2000.06.009

摘要

用RT-PCR扩增了12个不同时期分离的HCV毒株E2基因主要抗原区域的cDNA片段并对其进行了序列测定.应用DNAstar序列分析软件对所测的12个HCV毒株与国内外已知的6个毒株Alfort株、Ald株、Brescia株、Gpe株、C株、CW株及早期已测定的HCLV株、HCVSM株和北京顺义株(BJSY2/96)3个毒株的相应片段进行了同源性比较分析.E2基因主要区域长度均为224bp,包括从HCV2485到2708位的E2基因B、C区域.所测的疫苗株HCLV与国外测得的疫苗株C株核苷酸及氨基酸同源性分别为99.1%和100%,表明目前应用的疫苗株是稳定的;用目前我国流行的部分野毒株对HCLV株免疫猪的攻击试验表明,HCLV对野毒株均具有很好的免疫力,这与序列分析结果相吻合.根据系统树分析,可将HCV分为两大群,5株90年代的野毒株及1株80年代的野毒株(其中北京3株、河南2株、广东1株)均与国内外C株、标准株属同一群(即第一群),其核苷酸及氨基酸的同源性分别为85.7%～100%和83.8%～100%;与Alfort株同属第二群的有6个野毒株(广西北海、辽宁、河北黄骅、吉林、深圳光明、四川成都),其中80年代与90年代的野毒株各有三株,核苷酸及氨基酸的同源性分别为84.3%～100%和85.1%～100%;21株HCV的核苷酸及氨基酸的同源性分别为78.1%～100%和78.4%～100%.两群之间的特征性差异表现在713和729位氨基酸位点的不同,经分析发现猪瘟野毒株具有复杂性与多样性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵耘		4	86	4.0	4.0
2	王在时		8	111	5.0	8.0
3	王琴		5	100	4.0	5.0
4	李博		5	97	4.0	5.0
5	丘惠深		6	109	5.0	6.0