水稻条纹病毒北京双桥(RSV-SQ)分离物RNA4片段序列分析

• 作者: 于群 吴祖建 林含新 林奇英 谢联辉 魏太云
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻条纹病毒 亲缘关系 序列分析
• 年，卷（期）: 2000,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 225-228
• 页数: 5页
• 分类号: S5
• 字数: 3098字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2000.03.005

摘要

对我国水稻条纹病毒(Rice stripe virus,RSV)北京双桥(RSV-SQ)分离物RNA4片段进行克隆及测序,结果表明RNA4全长为2 157 bp.序列同源性比较发现,在核苷酸水平上,SQ分离物与T、M及CX分离物的vRNA4 ORF同源性分别为98.3 %、98.3 %和96.1 %,vcRNA4 ORF的同源性分别为98.1 %、97.8 %和94.0 %,RNA4 IR的同源性分别为94.8 %、89.4 %和85.4 %;在氨基酸水平上,vRNA4 ORF的同源性分别为100 %、98.9 %和98.9 %,vcRNA4 ORF的同源性均为97.6 %.由此可见,SQ分离物与T分离物的亲缘关系较与M分离物要近,与CX分离物虽同属中国分离物,但其亲缘关系较与日本T、M分离物要远.序列分析同时还发现,这4个分离物5'端非编码区序列完全相同,3'端非编码区只有CX分离物有2个核苷酸发生变化,并且在RNA4 IR上均含有A、U 碱基富集带和反向重复序列,可形成发夹结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林含新	福建农业大学植物病毒研究所	8	193	8.0	8.0
2	魏太云	福建农业大学植物病毒研究所	7	184	7.0	7.0
3	吴祖建	福建农业大学植物病毒研究所	14	337	9.0	14.0
4	林奇英	福建农业大学植物病毒研究所	18	463	11.0	18.0
5	谢联辉	福建农业大学植物病毒研究所	30	735	15.0	27.0
6	于群	福建农业大学植物病毒研究所	1	32	1.0	1.0