利用RFLP、SSR、AFLP和RAPD分子标记对15个玉米(Zea may s L.)骨干自交系进行遗传多样性分析,继而研究分子标记遗传距离与105个双列杂交组合的产量及特殊配合力的相关性,探讨预测杂种优势的可能性.结果表明:(1)利用分子标记把15个供试材料划分为唐四平头、旅大红骨、兰卡斯特、瑞德和PN共5个类群,与系谱分析基本一致;(2)分子标记遗传距离与F1产量、分子标记特殊遗传距离与特殊配合力之间都呈显著正相关 (P<0.01),相关系数介于0.52~0.72之间,但相关程度还不足以预测杂种优势.使用与杂种优势相关的QTL连锁的分子标记位点可能提高杂种优势的预测能力,但最终解决将依赖于杂种优势遗传机理的阐明.