我国首次分离的辛德毕斯病毒(XJ-160病毒株)全基因组核苷酸序列测定

• 作者: 付士红 何海怀 侯云德 周国林 李富胜 李蕾 梁国栋 金奇
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 辛德毕斯病毒 甲病毒 基因组
• 年，卷（期）: 2000,（2）
• 所属期刊栏目: 人与动物病毒
• 页码范围: 102-105
• 页数: 4页
• 分类号: R373.3|Q522+6
• 字数: 3009字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2000.02.002

摘要

对我国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160病毒株全基因组核苷酸序列进行测定,阐明该病毒基因组与国外株的差异,了解其分子致病机理.测序结果显示,XJ-160病毒全基因组除5′末端帽子结构和3′末端多聚腺苷酸尾外共11626个核苷酸,编码3731个氨基酸.非结构基因的编码区长7464核苷酸(60nt～7523nt),编码2486氨基酸,翻译成四种非结构蛋白(nonstructural protein,nsp1-4).结构基因长3738核苷酸(7568～11306),编码1245个氨基酸,翻译成三种结构蛋白和两个小分子肽(capsid,E1-3、6k).病毒基因组5′末端和3′末端及结构基因和非结构基因之间分别有59个核苷酸、45个核苷酸和323个核苷酸的非编码区.核苷酸序列分析表明,XJ-160病毒具备典型的甲病毒属辛德毕斯病毒基因组特征,与标准辛德毕斯病毒AR339病毒株相比,核苷酸序列存在18%差异,氨基酸差异为8%.这是我国完成的第一株辛德毕斯病毒全基因组序列测定,序列已输入国际基因库(GenBank AF103728).