蛋白质表面功能区的嫁接

• 作者: 来鲁华 梁世德 毛凤楼 江林 肖岚 韩玉真
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 嫁接 叠加 形状互补 打分函数 蛋白质工程
• 年，卷（期）: 2000,（10）
• 所属期刊栏目: 简报
• 页码范围: 1052-1056
• 页数: 5页
• 分类号: Q51
• 字数: 4630字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074X.2000.10.009

摘要

报道了一种蛋白-蛋白相互作用表面位点的嫁接方法. 首先确定被嫁接的配体表面结合区的重要残基, 在骨架蛋白中搜索适合于嫁接这些残基的位点. 基于对映残基的Ca , Cb 原子坐标, 将骨架蛋白叠加到配体蛋白上, 评估骨架蛋白与受体蛋白的互补性并留下互补性较好的骨架蛋白.细调骨架蛋白与受体蛋白的相对位置, 使之具有合理的界面堆积密度. 然后在骨架蛋白选出的位置上移植配体蛋白相应的残基. 另外, 对于与受体有严重碰撞的残基, 或不能形成盐桥的包埋带电侧链, 也予以突变. 突变后的骨架蛋白与受体一起用Charmm进行能量优化. 用刚性蛋白-蛋白复合物结构回归出一个适合于嫁接研究的打分函数. 利用打分函数对骨架蛋白的结合自由能进行评估.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	来鲁华	北京大学化学与分子工程学院物理化学研究所	26	148	7.0	11.0
2	毛凤楼	北京大学化学与分子工程学院物理化学研究所	3	59	3.0	3.0
3	韩玉真	北京大学化学与分子工程学院物理化学研究所	5	64	3.0	5.0
4	梁世德	北京大学化学与分子工程学院物理化学研究所	2	3	1.0	1.0
5	肖岚	北京大学化学与分子工程学院物理化学研究所	2	10	2.0	2.0
6	江林	北京大学化学与分子工程学院物理化学研究所	2	8	2.0	2.0