边界元法与广义Langevin动力学相结合的模拟方法

• 作者: 卢本卓 王存新 陈慰祖
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 物理学
• 关键词: 溶剂平均力势 边界元法 摩擦记忆函数 广义Langevin动力学
• 年，卷（期）: 2000,（14）
• 所属期刊栏目: 简报
• 页码范围: 1482-1486
• 页数: 5页
• 分类号: O3
• 字数: 2963字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074X.2000.14.004

摘要

提出了将水化力加到广义Langevin方程中的新的模拟方法(GLDBEM).水化力通过边界元方法 (BEM)求出,包括溶质分子与表面诱导电荷的Coulomb相互作用和溶剂对分子表面的压力,摩擦记忆函数采用指数模型.以环苞霉素A(CPA)为研究对象,并将GLDBEM模拟结果与分子动力学(MD)模拟和通常的随机动力学(SD)模拟结果作了比较.结果表明GLDBEM模拟方法对研究分子的结构和动力学性质均比SD模拟有明显改善.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈慰祖	北京工业大学生物医学工程中心	59	243	8.0	11.0
2	王存新	北京工业大学生物医学工程中心	82	340	9.0	13.0
3	卢本卓	北京工业大学生物医学工程中心	5	26	2.0	5.0