拓扑树间的通经拓扑距离

• 作者: 谭远德
• 来源期刊: 动物分类学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 系统树 mtDNA 拓扑距离 建树方法
• 年，卷（期）: 2001,（4）
• 页码范围: 440-447
• 页数: 8页
• 分类号: Q332
• 字数: 5073字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0739.2001.04.004

摘要

给出了一种新的系统树间的拓扑距离.使用NJ、MP、UPGMA等3种方法对13种动物的线粒体中14个基因(含组合的)DNA序列数据进行系统树的构建.利用分割拓扑距离和本文给出的通经拓扑距离对这14种系统树之间及其与真树进行比较.结果显示,NJ法对获得已知树的有效率最高,MP法次之,UPGMA法最低.这14种DNA序列所构建的系统树与已知树的拓扑距离基本上是随其DNA序列长度增加而减小,但两者的相关系数并未达到显著水平.分割拓扑距离在总体上可反映树间的拓扑结构差异,但其测度精确度比通经拓扑距离要低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谭远德	湖南师范大学生命科学学院	20	429	9.0	20.0