肝癌相关新基因HC6的全长cDNA克隆及分析

• 作者: 万大方 温传俊 覃文新 赵新泰 顾健人
• 来源期刊: 肿瘤
• 学科: 医学
• 关键词: 肝细胞肝癌 新基因:PAC579:RACE 表达序列
• 年，卷（期）: 2001,（6）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 449-451
• 页数: 3页
• 分类号: R735.7
• 字数: 2697字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3781/j.issn.1000-7431.2001.06.017

摘要

目的染色体17p13.3区域内多态性位点D17S926是肝细胞肝癌(HCC)杂合性缺失热点,PAC579克隆含有D17S926位点,本实验目的在于从PAC579克隆中寻找与肝癌相关的表达序列(ESTs),对有意义的EST片段克隆其全长cDNA.方法根据PAC579克隆中现有的9个代表新基因的EST序列设计引物,对正常人肝cDNA文库作多聚酶链式反应(PCR)扩增检测,确定在肝组织中表达的EST,然后采用Southem杂交检测肝组织中表达的EST在27对肝癌和癌旁标本中杂合性生缺失(LOH)频率,选择缺失频率最高的EST克隆其全长cDNA,Northem杂交验证后测序并作进一步分析.结果 PAC579现有9个代表新基因的EST中有3个在肝组织表达,其中EST6在肝癌中LOH频率高达54.6%(6/11),通过RACE-PCR方法,得到约1.8kb全长cDNA克隆,与Northerm杂交结果一致,结构及同源性分析显示该基因是一新基因,编码一个包含134个氨基酸,分子量约为14.7kD的蛋白质,另外发现碱基序列313-592属于ALu同源序列,重新命名为肝癌相关基因6(HC6).结论通过定位克隆方法从肝癌杂合性缺失热点得到一个新基因HC6,该基因与肝癌的关系有待进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	覃文新		22	137	7.0	11.0
2	万大方		44	296	11.0	15.0
3	顾健人		62	348	10.0	15.0
4	赵新泰		21	47	4.0	6.0
5	温传俊		2	4	1.0	2.0