用聚类法分析受抗真菌物质处理后的酵母细胞全基因表达谱

• 作者: 周一鸣 周玉祥 安爽 张亮 张岩 曾令文 果德安 程京
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 微阵列DNA芯片 抗真菌药物 聚类分析
• 年，卷（期）: 2002,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 538-542
• 页数: 5页
• 分类号: Q78
• 字数: 2702字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3282.2002.04.010

摘要

微阵列DNA芯片技术可以并行分析成千上万个基因的表达情况,它为研究药物的作用机制提供了一个新的高效技术平台.用9种已知和未知作用机理的抗真菌化合物处理酵母细胞,并得到酵母细胞的全基因表达谱,然后对其进行聚类分析.结果表明作用机制类似的化合物具有相近的聚类关系.两性霉素B和制霉菌素、酮康唑和克霉唑都是已知的作用机制类似的抗真菌药物.通过对基因表达谱进行聚类分析,发现前一组和后一组分别被聚类在一起.另外已知澳洲茄胺抑制的是细胞膜上麦角固醇的合成,聚类分析表明它与酮康唑,克霉唑的聚类很靠近.对微阵列DNA芯片产生的基因表达谱进行聚类分析,由于作用机制相似的药物会被聚类在一起,因此根据未知药物和已知药物的聚类关系,可以了解未知药物的作用机制,这对于加速新药开发的步伐具有十分重要的意义.