肺癌诊断基因的初步筛选

• 作者: 吴德昌 张开泰 王升启 笪冀平 范保星 谢玲 项小琼
• 来源期刊: 循证医学
• 学科: 医学
• 关键词: 肺肿瘤 诊断 基因 BEP2D细胞 cDNA芯片 抑制消减杂交
• 年，卷（期）: 2002,（2）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 75-79
• 页数: 5页
• 分类号: R734.2
• 字数: 3732字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-5144.2002.02.007

摘要

目的筛选肺癌细胞恶性转化不同时期差异表达的基因,以期用于肺癌的诊断.方法应用抑制消减杂交技术(SSH)、测序、cDNA芯片(cDNA Microarray)、northern blot.结果利用SSH建立了永生化人支气管上皮细胞(BEP2D)恶性转化不同时期差异表达基因的cDNA文库,其中,A消减文库(BEP2D细胞的cDNA为tester,α粒子照射BEP2D细胞后35代恶性转化细胞R15Hp35的cDNA为driver)有416个克隆,B消减文库(α粒子照射BEP2D细胞后20代转化细胞R15Hp20的cDNA为tester,BEP2D和R15Hp35细胞的cDNA混合后为driver)有301个克隆,C消减文库(R15Hp35细胞的cDNA为tester,BEP2D细胞的cDNA为driver)有586个克隆.对文库中107个克隆单向测序发现:19个克隆在GenBank中没有查到对应的同源序列,其它88个克隆共代表了76个不同的已知基因.然后,将3个文库中全部克隆的cDNA制作成cDNA芯片,用该芯片筛选了15例肺癌组织、5例肺癌旁组织和其他8种癌组织(肝癌、胃癌、食管癌、乳腺癌、白血病、子宫内膜癌、脑神经角质瘤和结肠癌)中mRNA的表达差异.结果,获得肺癌组织高于肺癌旁组织表达的cDNA 26个,肺癌旁组织高于肺癌组织表达的31个,2者高于其他8种癌组织的分别为:肺癌旁组织中63个,肺癌组织中87个.将这208个具较大差异表达的基因重新制作成cDNA芯片,再选用临床上同一鳞癌病人鳞癌和鳞癌癌旁组织各1例与该芯片杂交,发现这些筛选出的基因的确在癌组织和癌旁组织中存在较大差异.结论这些初步筛选出的差异表达基因有望成为肺癌诊断的侯选基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王升启	军事医学科学院放射医学研究所分子毒理研究室	315	3297	28.0	41.0
2	笪冀平	空军总医院病理科	22	101	5.0	9.0
3	张开泰	军事医学科学院放射医学研究所分子毒理研究室	35	257	10.0	14.0
4	谢玲	军事医学科学院放射医学研究所分子毒理研究室	18	136	7.0	11.0
5	范保星	军事医学科学院放射医学研究所分子毒理研究室	11	153	8.0	11.0
6	项小琼	军事医学科学院放射医学研究所分子毒理研究室	3	49	3.0	3.0