不具有3-碱基周期性的编码序列初探

• 作者: 张静 石秀凡
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 编码序列 Fourier分析 3-碱基周期性 非3-碱基周期性
• 年，卷（期）: 2002,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 267-272
• 页数: 6页
• 分类号: Q617
• 字数: 3803字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3282.2002.02.021

摘要

对12 0个较短编码序列(＜1 200 bp)的Fourier频谱进行分析表明,3-碱基周期性在短编码序列中并不是绝对存在的.统计分析提示,编码序列有无3-碱基周期性与序列的碱基组成和分布、所编码蛋白质氨基酸的选用和顺序以及同义密码子的使用都有一定的关系.一般地,非周期-3序列中A+U含量高于G+C含量,周期-3序列的情况则相反;非周期-3序列中碱基在密码子三个位点上的分布比周期-3序列中的分布均匀;非周期-3序列密码子和氨基酸的使用偏向没有周期-3序列的大.在利用Fourier分析方法预测DNA序列中的基因和外显子时,应充分考虑到这些现象.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石秀凡	中国科学院昆明动物研究所	13	225	6.0	13.0
2	张静	云南大学应用统计中心	50	141	7.0	10.0