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中国人群中HIV-1辅助受体CCR5基因新突变位点及CCR5-894C缺失基因多态性分析
中国人群中HIV-1辅助受体CCR5基因新突变位点及CCR5-894C缺失基因多态性分析
作者:
侯静
刘明旭
洪卫国
王波
王福生
金磊
雷周云
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
HIV-1
受体,CCR5
多态性,限制性片段长度
基因
摘要:
目的研究中国人群HIV-1辅助受体CCR5基因编码区新的单核苷酸多态性(SNP)位点;分析CCR5-894C缺失等位基因在中国普通人群和HIV-1高危人群中的分布特点和相关意义.方法针对CCR5编码区用2对引物进行PCR扩增,设计测序引物对45例汉族人样本进行PCR产物直接测序,用DNAstar分析测序结果,寻找SNP位点.采用错配PCR-RFLP法对中国汉族、蒙族、藏族普通人群,性传播疾病和静脉吸毒高危人群及HIV-1携带者,共627份样品进行了CCR5-894C缺失等位基因分型.结果在45例汉族人CCR5基因编码区共发现6个SNP位点,4个(184A→G、503G→T、668G→A、999G→T)引起氨基酸改变,两个无义突变;此外还发现1个单碱基缺失(894C缺失),引起移码突变和提前终止.其中184A→G、503G→T、999G→T三个中国汉族人所特有的SNP位点为首次发现,它们的等位基因频率分别为1.11%,21.1%和10.0%;其中503G→T分布明显不符合Hardy-Weinberg平衡.汉、藏、蒙等民族的普通人群CCR5-894C缺失等位基因频率为1.11%、0.53%和0.在汉族HIV-1性传播、静脉吸毒传播的高危人群中,HIV-1阳性个体和阴性个体间CCR5-894C缺失等位基因频率差异无显著意义,与汉族普通人群比较差异也无显著意义.结论中国人CCR5基因的SNP位点有自己的特点,共发现4个引起氨基酸改变的SNP位点(其中3个为首次发现),1个引起移码突变的单碱基缺失.汉族人群中存在CCR5-894C缺失突变,但突变频率很低.这些SNP和缺失突变对于HIV-1感染和艾滋病病程的影响值得进一步研究.
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文献信息
篇名
中国人群中HIV-1辅助受体CCR5基因新突变位点及CCR5-894C缺失基因多态性分析
来源期刊
中华医学杂志
学科
医学
关键词
HIV-1
受体,CCR5
多态性,限制性片段长度
基因
年,卷(期)
2002,(21)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
1468-1472
页数
5页
分类号
R511
字数
4459字
语种
中文
DOI
10.3760/j:issn:0376-2491.2002.21.009
五维指标
传播情况
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节点文献
HIV-1
受体,CCR5
多态性,限制性片段长度
基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
中华医学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
周刊
ISSN:
0376-2491
CN:
11-2137/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区宣武门东河沿街69号
邮发代号:
2-588
创刊时间:
1915
语种:
chi
出版文献量(篇)
21130
总下载数(次)
49
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英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
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学科类型:
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