丙型肝炎病毒核心蛋白寡核苷酸适配子的筛选与鉴定

• 作者: 孙红琰 彭剑淳 王全立 詹林盛 邵宁生
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 丙型肝炎病毒 核心蛋白 SELEX 寡核苷酸适配子
• 年，卷（期）: 2002,（5）
• 所属期刊栏目: 检测技术
• 页码范围: 578-581
• 页数: 4页
• 分类号: R511
• 字数: 3701字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2002.05.037

摘要

目的筛选、鉴定抗HCV核心蛋白(C 蛋白)的寡核苷酸适配子(aptamers). 方法利用systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX)技术,以HCV C蛋白为靶分子,从体外合成的81bp随机单链DNA文库中筛选与HCV C蛋白特异结合的寡核苷酸适配子,并进行了解离常数(Kd)测定和适配子序列测定.再分别利用Clustal W软件包和DNA Folding Sever分析适配子的一级结构和二级结构. 结果经过9轮循环筛选,随机ssDNA库与HCV C蛋白的结合率从0.5%上升到32.5%.所有的一级结构没有共同的同源序列,但可分5个家族,每个家族具有共同的保守序列.二级结构分析表明,适配子形成的茎环、凸环结构可能是与HCV C蛋白结合的结构基础.其中寡核苷酸适配子C4与HCV C蛋白特异结合的亲和力最高,Kd值为68nmol/L. 结论利用随机寡核苷酸文库成功获得抗HCV C蛋白的寡核苷酸适配子.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邵宁生	军事医学科学院基础医学研究所	79	523	11.0	20.0
2	孙红琰	军事医学科学院输血研究所	20	155	8.0	12.0
3	王全立	军事医学科学院输血研究所	126	899	16.0	25.0
4	詹林盛	军事医学科学院输血研究所	64	450	11.0	19.0
5	彭剑淳	军事医学科学院输血研究所	23	345	8.0	18.0