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摘要:
对猪繁殖与呼吸综合征病毒的非结构基因(ORFl)和非编码区分别进行了克隆和测序,并对其基因特征作了分析.结果表明,CH-la株ORFl全长11882nt,其中ORFla长7512nt、ORFlb长4374nt.它们与VR2332株的核苷酸同源性分别为89%、92%;与LV株的核苷酸同源性分别为54%、63.3%.ORFl编码两个聚合蛋白,其中ORFla编码的聚合蛋白经裂解后产生6个成熟的非结构蛋白(Nsplα、Nsplβ、Nsp2-5),以Nsp2的变异性最为显著,它与LV株的氨基酸同源性为41%.ORFlb编码的聚合蛋白经裂解后,产生4个成熟的非结构蛋白(RdRp CP24),其中RdRp为病毒的复制酶,CP4表现出较大的变异性,与LV株的氨基酸同源性为48%.在ORFla-ORFlb的衔接区有保守的庚核苷酸滑动序列和拟节结构,它们是核糖体移码翻译所必需的结构.在基因组末端存在非编码区,其中5'NCR长190nt,比LV株5'NCR短31nt,其核苷酸同源性为61%.3'NCR长151nt,比LV株3'NCR长37nt,保守性稍高,其与VR2332株和LV株的核苷酸同源性分别为95.4%和78.2%.在3'NCR末端有一个poly(A)尾巴,长20nt.在Poly(A)尾上游有保守的八核苷酸序列,是复制酶识别并结合的区域.本研究进一步证实CH-1a株在基因型上属于北美洲型.
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文献信息
篇名 猪繁殖与呼吸综合征病毒CH-la株非结构基因的分子克隆及其基因特征的研究
来源期刊 中国预防兽医学报 学科 农学
关键词 PRRSV 非结构基因 非结构蛋白编码区 序列分析
年,卷(期) 2002,(2) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 81-87
页数 7页 分类号 S852.65|Q78
字数 5238字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1008-0589.2002.02.001
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研究主题发展历程
节点文献
PRRSV
非结构基因
非结构蛋白编码区
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国预防兽医学报
月刊
1008-0589
23-1417/S
大16开
哈尔滨市南岗区马端街427号
14-70
1979
chi
出版文献量(篇)
4599
总下载数(次)
3
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
国家重点基础研究发展计划(973计划)
英文译名:National Basic Research Program of China
官方网址:http://www.973.gov.cn/
项目类型:
学科类型:农业
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