应用EST策略鉴定人类新基因UBAP1的数字化差异表达图谱

• 作者: 张晓梅 李伟芳 李小玲 李桂源 王洁如 王蓉 钱骏
• 来源期刊: 癌症
• 学科: 生物学
• 关键词: 表达序列标签 基因表达 UBAP1基因
• 年，卷（期）: 2002,（3）
• 所属期刊栏目: 快速报道
• 页码范围: 225-228
• 页数: 4页
• 分类号: Q753|Q755
• 字数: 3271字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-467X.2002.03.001

摘要

背景与目的:UBAP1(ubiquitin associated protein1)基因是我们先前在人类染色体9p21-22鼻咽癌杂合性丢失(loss of heterozygosity,LOH)高频区所获得的一个鼻咽癌相关新基因.进一步地,我们应用EST策略鉴定UBAP1基因在多种肿瘤组织中的差异表达谱.方法:采用基于生物信息学的电子杂交方法,即以UBAP1基因的全长cDNA为"探针",利用计算机对人类表达序列标签(expressed sequencetag,EST)和Unigene等数据库中代表UBAP1的EST在各类肿瘤及相应正常组织cDNA文库中的分布进行综合分析,研究UBAP1基因的数字化差异表达图谱.同时采用差异RT-PCR方法对UBAP1在3种肿瘤活检组织中的差异表达进行验证.结果:电子杂交结果表明UBAP1基因不仅在42种人类正常组织中广泛表达,而且在11种肿瘤组织中存在可能的表达差异,尤其是在脑瘤、乳腺癌、结肠癌、皮肤癌、睾丸癌和宫颈癌等肿瘤组织中表达显著下调(P<0.05),而在肾癌、胰腺癌中高表达(P<0.05).进一步采用差异RT-PCR方法发现UBAP1基因在64%的脑膜瘤和72%的结直肠癌活检组织中具有明显表达缺失/下调.结论:UBAP1基因有可能与多种肿瘤的发生发展密切相关,有必要深入研究UBAP1基因的表达异常参与肿瘤发生发展的分子机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张晓梅	中南大学湘雅医院消化内科	19	158	7.0	12.0