表达序列标签数据库搜索鉴定小鼠UBAP1基因及其数字化表达分析

• 作者: 周鸣 张必成 李伟芳 李小玲 李忠花 李桂源 王洁如 董利 钱骏
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 医学
• 关键词: UBAP1基因 基因克隆 表达序列标签 组织表达
• 年，卷（期）: 2002,（2）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 323-327
• 页数: 5页
• 分类号: Q78|R739
• 字数: 3895字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3282.2002.02.033

摘要

UBAP1(ubiquitin associated protein 1)基因是最近克隆的一个定位于人类染色体9p21-22鼻咽癌杂合性丢失高频区的泛肽相关蛋白家族新成员.为了深入研究UBAP1基因的功能,利用计算机对表达序列标签(expressed sequence tag, EST)、UniGene等数据库进行综合搜索分析,结合cDNA克隆测序的方法, 成功地获得了UBAP1基因在小鼠中的同源基因.小鼠UBAP1基因cDNA全长为2 676 bp,编码一个由441个氨基酸组成的蛋白质,在其蛋白质C端只有一个泛肽相关功能域(UBA domain).与人UBAP1基因相比,两者编码的氨基酸序列有89%相同.基于EST的数字化表达分析显示UBAP1基因在小鼠正常组织中广泛高表达.