从基于结构定义的序列模体识别蛋白质的超家族

• 作者: 刘次全 黄京飞
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白质酪氨酸磷酸酶 序列模体 超家族的序列识别 假定蛋白质 分子进化
• 年，卷（期）: 2002,（8）
• 所属期刊栏目: 简报
• 页码范围: 591-595
• 页数: 5页
• 分类号: Q5
• 字数: 4077字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074X.2002.08.008

摘要

以进化上相距较远的蛋白质酪氨酸磷酸酶Ⅰ和Ⅱ为例, 通过结构比较和基于结构的序列比对及共同保守区域残基替换模式的分析, 定义了基于结构的序列模体. 利用这种新的模体对SWISS-PROT和TrEMBL蛋白质序列库进行搜索, 可特异性地同时识别磷酸酶Ⅰ和Ⅱ, 其识别正确率可达98.4%. 而在此之前, 尚未见可同时识别磷酸酶Ⅰ和Ⅱ序列模体的报道.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄京飞	中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室	13	179	5.0	13.0
2	刘次全	中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室	36	289	8.0	16.0