贝叶斯推论重建乳头瘤病毒的进化系统

• 作者: 张原 敖滨 郑光宇 郑楠
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 乳头瘤病毒 系统学 进化 贝叶斯
• 年，卷（期）: 2003,（4）
• 所属期刊栏目: 人与动物病毒
• 页码范围: 293-300
• 页数: 8页
• 分类号: R373
• 字数: 6507字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2003.04.002

摘要

基于90种乳头瘤病毒的L1基因和E2基因的DNA全序列,应用似然比检验和贝叶斯推论重建病毒的系统发育树,并在此基础上讨论病毒分子系统学研究的一般原则和方法.同时比较研究贝叶斯推论和过去常用的最小进化、最大简约、最大似然三种建树算法的优劣.结果表明:乳头瘤病毒可分为4超群,不同超群的乳头瘤病毒宿主和组织特异性不同.引起人宫颈癌的高危和低危乳头瘤病毒在进化上分别具有相近的亲缘关系,高危类群起源于共同祖先.算法的比较研究表明,贝叶斯推论作为进化生物学的最新进展,在计算速度和可靠性上明显优于其它算法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑光宇	北京师范大学生命科学学院	34	307	10.0	16.0
2	郑楠	北京师范大学生命科学学院	6	37	4.0	6.0
6	张原		1	4	1.0	1.0
7	敖滨	北京师范大学物理学系	1	4	1.0	1.0