VLDL-受体的配体结合结构域结构分析

• 作者: 刘志国 屈伸 江会峰
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 极低密度脂蛋白受体 结构预测 同源模建
• 年，卷（期）: 2003,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 20-24
• 页数: 5页
• 分类号: Q518.1
• 字数: 3438字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2003.01.005

摘要

极低密度脂蛋白受体(VLDL-R)的配体结合域具有8个富含半胱氨酸的配体结合重复序列(ligand-binding repeats,LBR),被认为是与配体结合的部位.该受体与含7个类似重复序列的低密度脂蛋白受体(LDL-R)的配体结合特性明显不同.为了明确VLDL-R中8个LBR在配体结合中的作用并探讨结合位点的结构,本研究采用计算机辅助蛋白质结构预测方法,在二级结构分析的基础上,通过同源建模方法预测受体N-端328个氨基酸的配体结合域空间结构,结果显示该区域呈现弧形口袋样结构,其中前3个LBR结构紧凑,呈棒状,负电荷相对集中,推测这一特征结构是配体结合的重要结构基础,结构分析同时表明在LBR5与LBR6之间连接区的弹性结构可以赋予结合位点一定的伸缩性,利于其与不同配体的结合.本研究预测结果首次提出了VLDL-R配体结构域结构及结合位点的结构特征,并与已有的实验结果一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘志国	武汉工业学院生物与化学工程系	58	514	12.0	20.0
2	屈伸	华中科技大学同济医学院生物化学与分子生物学系	53	375	10.0	17.0
3	江会峰	武汉工业学院生物与化学工程系	1	3	1.0	1.0