基于GO与基因表达谱挖掘特征基因功能类

• 作者: 喻辉 李霞 郭政
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因表达谱 差异表达 特征功能类 Gene Ontology
• 年，卷（期）: 2003,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 15-19
• 页数: 5页
• 分类号: Q617
• 字数: 4591字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2003.01.004

摘要

我们研制了基于Gene Ontology与基因表达谱挖掘与实验条件相关的特征基因功能类的算法OntoFexed,它的特点是分别采用信息增益方法和Rand Index评价单个基因功能类与一组基因功能类鉴别差异表达基因与不差异表达基因的能力.算法的优点是充分利用了GO的结构信息来搜索特征功能类,并能给出各个抽象层次上的特征功能类.我们将OntoFexed应用于腺癌数据集和NCI60数据集,发现OntoFexed确能发掘与实验条件相关的功能类,且算法对主要的参数有较高的稳健性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭政		43	323	11.0	16.0
3	李霞		108	479	12.0	18.0
9	喻辉		3	24	3.0	3.0