广东省SARS冠状病毒分离株S基因全序列分析

• 作者: 周惠琼 张欣 方苓 李晖 江立敏 郑夔 郑焕英 陈秋霞
• 来源期刊: 华南预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 严重急性呼吸综合征 冠状病毒属 病毒结构蛋白类 基因,结构,病毒 序列分析
• 年，卷（期）: 2003,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 5-8
• 页数: 4页
• 分类号: R563.1|R373.9
• 字数: 3278字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-5039.2003.05.002

摘要

目的测定并分析广东省传染性非典型肺炎病人标本中分离到的严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒的S基因全序列.方法选取3株来自中山市、广州市、江门市传染性非典型肺炎病人的SARS冠状病毒分离株,设计8对相互嵌套的S基因特异引物扩增病毒的S基因,直接进行PCR产物测序,将所测的序列与从GenBank上获得的世界各地10株SARS冠状病毒分离株的S基因序列用DNASTAR软件包进行基因变异分析.结果 3株毒株经PCR扩增后,均可获得大小分别为513、589、527、509、621、501、578、678 bp的基因片段,测序并拼接可获得一长3 768个碱基S基因全基因序列,编码1 256个氨基酸;基因序列比对结果显示,与世界各地10株毒株比较,核苷酸和氨基酸的最大同源性在99.7%～100.0%和99.2%～99.9%之间,其变异主要发生在S蛋白的S1片段.结论 SARS冠状病毒的S蛋白是比较保守的,但S1片段上某些位点的变异可能是病毒的毒力不同的主要原因.