从中国对虾ESTs中筛选微卫星标记的研究

• 作者: 周令华 徐鹏 田丽萍 相建海
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中国对虾 表达序列标签 微卫星
• 年，卷（期）: 2003,（3）
• 页码范围: 213-218
• 页数: 6页
• 分类号: S917.4
• 字数: 3649字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2003.03.004

摘要

利用生物信息学方法在含有10446个中国对虾ESTs的数据库中进行微卫星序列的筛选,共发现微卫星序列229个,占整个ESTs数据库的2.19%,其中含双碱基重复序列146个和3碱基重复序列58个,分别占在ESTs数据库中发现微卫星序列总数的63.76%和25.33%,大部分发现的微卫星序列均为Perfect形式的重复序列.根据筛选得到的微卫星序列设计并合成引物19对进行多态性检测,在有扩增产物的16对引物中,首次筛选得到8个中国对虾微卫星标记,并对这些微卫星标记进行了等位基因频率、观测杂合度、期望杂合度、PIC值等统计学指标的评价.结果表明,在8个微卫星位点上,等位基因的数目从5到15不等,等位基因长度从165～305bp,期望杂合度和多态性信息含量分别为0.59到0.89和0.56到0.88,表明这8个中国对虾微卫星标记完全适合于遗传分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	相建海	中国科学院海洋研究所	125	2734	33.0	47.0
2	徐鹏	中国科学院海洋研究所	53	803	12.0	28.0
3	周令华	中国科学院海洋研究所	4	144	3.0	4.0
4	田丽萍	中国科学院海洋研究所	4	130	2.0	4.0