鸡传染性支气管炎病毒国内分离D971株 5a、5b及核蛋白基因的分子特征

• 作者: 刘丽玲 刘宝全 刘玉芬 刘胜旺 孔宪刚 荣骏弓
• 来源期刊: 中国预防兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 传染性支气管炎病毒 5a、5b与N基因 分子特征
• 年，卷（期）: 2003,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 81-87
• 页数: 7页
• 分类号: S852.65|Q78
• 字数: 7545字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0589.2003.02.001

摘要

本研究参照已发表的鸡传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus,IBV)基因序列,设计合成了一对引物,经反转录-聚合酶链式反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)技术扩增得到了IBV国内分离株D971的5a、5b与核蛋白(Nucleocapsid,N)基因,片段长约1.7kb,并将该基因进行了克隆和序列测定.与国内外部分已发表毒株比较表明:D9715a基因与Beau、CU-T2、D1466、DE072及SD/97/02毒株的5a基因核苷酸序列同源性在85.9%～93.9%之间,氨基酸序列同源性为78.5%～93.8%;D9715b基因与上述毒株的5b基因核苷酸序列同源性在91.6%～96.8%之间,氨基酸序列同源性为87.8%～93.9%,比5a基因保守;N基因与Beau、CU-T2、Ark99、M41、H52、VicS、SD/97/02、X、HB、DB及ZJ971毒株的核苷酸序列同源性为87.0%～91.5%,氨基酸序列同源性为89.7%～93.6%.对文献报道的N基因三个保守位置同源性比较发现,D971 N基因第198～264位核苷酸及其推导的氨基酸与上述11株毒株的相应区域同源性分别为86.6%～92.5%和90.5%～100%;第543～702位核苷酸及其对应的氨基酸序列同源性分别为79.4%～90.6%和83.3%～96.3%;第993～1122位核苷酸及其对应的氨基酸序列同源性分别为87.1%～96.0%和75.0%～95.0%.以上结果表明,我国地方分离株D971与国内外不同致病型毒株相比,5b基因比5a基因保守.N基因的不同区域变异规律不同,第198～264及543～702位与国内"腺胃型"毒株的同源性高,与肾型和呼吸型毒株的序列差异明显.第993～1122位变异独特,与国内常用疫苗株H52同源性高达95%,而与国内肾型和腺胃型毒株差异显著.这说明该毒株的5a、5b和N基因具有独特的分子特征.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘胜旺	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室	53	724	15.0	25.0
2	刘宝全	东北农业大学动物医学院	27	263	9.0	15.0
3	孔宪刚	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室	49	711	13.0	25.0
4	刘丽玲	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室	9	137	8.0	9.0
5	刘玉芬	东北农业大学动物医学院	9	153	6.0	9.0
6	荣骏弓	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室	11	65	4.0	8.0