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霍乱弧菌VPI毒力岛的tcpI-P和tcpH-A间隔区序列在不同菌株中的差异分析
霍乱弧菌VPI毒力岛的tcpI-P和tcpH-A间隔区序列在不同菌株中的差异分析
作者:
刘延清
卢明俊
芮勇宇
赵英伟
阚飙
高守一
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
霍乱弧菌
毒力岛
毒力共调菌毛
分化
摘要:
目的TcpA是霍乱弧菌主要定居因子毒素共调菌毛的主要亚单位,基因位于VPI毒力岛上.古典生物型和El Tor生物型霍乱弧菌菌株的tcpA序列有较大差异,同时毒力岛上其他一些区域,主要包括部分基因的间隔区序列也存在差异.我们已在不同El Tor流行株与非流行株以及非O1/非O139菌株中又发现4种新的tcpA序列.笔者拟探明这4种不同类型tcpA序列的菌株中,VPI毒力岛上其他几个差异片段(tcpI-P间隔区和tcpH-A间隔区)是否与相应tcpA序列有平行的变异关系、进而分析毒力岛和菌株分化的多样性.方法在tcpI-P和tcpH-A间隔区外侧保守区中设计引物,扩增包含这两个间隔区的片段并进行测序,计算比较序列差异.结果基因tcpH与tcpA之间的间隔区序列两两间比较的一致性在63.3%至95.3%之间;基因tcpI与tcpP之间的间隔区序列两两间比较的一致性在26.7%至100%之间.这些间隔区序列并没有像tcpA序列在这些菌株中的差异那样显示出类似的变异水平,甚至一些菌株的tcpA序列有较大差异时、某些区域反而高度一致.结论在不同tcpA序列的菌株中tcpI-P间隔区和tcpH-A间隔区及tcpA这三个片段分化变异的速率不同,并不具有平行性.这些序列的多样性反映了霍乱弧菌VPI毒力岛以及菌株分化的多样性.这种分化也提示可能与这些区域具有结合一些调控因子、从而对环境信号产生不同方式或程度的应答的功能有关.
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期刊文献
内容分析
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(/年)
文献信息
篇名
霍乱弧菌VPI毒力岛的tcpI-P和tcpH-A间隔区序列在不同菌株中的差异分析
来源期刊
中国预防医学杂志
学科
医学
关键词
霍乱弧菌
毒力岛
毒力共调菌毛
分化
年,卷(期)
2003,(2)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
92-96
页数
5页
分类号
R3
字数
3599字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1009-6639.2003.02.010
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
阚飙
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
120
614
11.0
19.0
2
高守一
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
21
65
5.0
7.0
3
刘延清
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
8
32
3.0
5.0
4
卢明俊
33
385
10.0
18.0
5
芮勇宇
第一军医大学热带军队卫生学系
7
20
3.0
3.0
6
赵英伟
6
31
2.0
5.0
传播情况
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引文网络
引文网络
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(0)
1997(1)
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二级参考文献(0)
2000(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2001(2)
参考文献(2)
二级参考文献(0)
2002(3)
参考文献(3)
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2003(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
2005(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
2009(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
霍乱弧菌
毒力岛
毒力共调菌毛
分化
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国预防医学杂志
主办单位:
中华预防医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1009-6639
CN:
11-4529/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区鼓楼西大街154号
邮发代号:
2-764
创刊时间:
2000
语种:
chi
出版文献量(篇)
5952
总下载数(次)
3
总被引数(次)
28489
相关基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)
英文译名:
National Basic Research Program of China
官方网址:
http://www.973.gov.cn/
项目类型:
学科类型:
农业
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