大豆花叶病毒杭州分离物基因组全序列测定及其结构分析

• 作者: 陈剑平 陈炯 黎昊雁
• 来源期刊: 科技通报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆花叶病毒 核苷酸序列 基因组结构 变异
• 年，卷（期）: 2003,（2）
• 页码范围: 90-93
• 页数: 4页
• 分类号: S432.41
• 字数: 2891字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7119.2003.02.002

摘要

测定了大豆花叶病毒杭州分离物(SMV-HZ)的基因组全序列 .该病毒基因组全长9588 个核苷酸,3'末端具poly(A)尾,包含单一开读框,编码一个350.07kD的多聚蛋白.基因组全序列与美国SMV G2、G7、N株系及我国黄淮5号株系(Y5)的核苷酸同一性分别为93%、93%、 94%和96%.多聚蛋白酶解后产生马铃薯Y病毒属典型的10个成熟蛋白.SMV-HZ与G2、G7、N的不同成熟蛋白间的氨基酸同一性为89%～100%;SMV-HZ与Y5的不同成熟蛋白间氨基酸同一性则较高,达97%～100%.多重分析显示了SMV-HZ与G2、G7、N、Y5之间的序列差异,G2、G7的P1 蛋白氨基酸序列明显不同于其他株系.对SMV-HZ与我国其他分离物也进行了序列比较,对CP蛋白氨基酸序列的系统进化树分析表明SMV-HZ与BJ分离物的亲缘性最高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈剑平	浙江省农业科学院病毒室	99	1300	19.0	30.0
2	陈炯	浙江省农业科学院病毒室	30	381	10.0	18.0
3	黎昊雁	浙江大学生命科学学院	5	92	5.0	5.0