志贺氏菌属各亚群菌株基因组"共有骨架"组成的分析

• 作者: 刘红 孙立连 彭俊平 杨剑 金奇 陈淑霞
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 医学
• 关键词: 志贺氏菌属 大肠杆菌K-12 全基因组微阵列 骨架序列
• 年，卷（期）: 2003,（23）
• 所属期刊栏目: 简报
• 页码范围: 2451-2546
• 页数: 6页
• 分类号: R37
• 字数: 6661字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074X.2003.23.009

摘要

不同原核生物在基因组组成上的差异是其生物学性状差异的基础. 然而,进化中亲缘关系较近的菌群, 其基因组除了含有群或株特异的基因外, 还含有反映它们起源和进化痕迹的"共有骨架"结构, 而这些"共有骨架"恰恰是它们基本生存能力和共有生物学性状的基础. 志贺氏菌在起源和进化上与大肠杆菌极为密切, 目前倾向于将二者划为同一个种. 利用大肠杆菌K-12全基因组及Sf301特异性ORFs的芯片研究了志贺氏菌4个群间的基因组组成. 结果显示, 分别有16% ～ 22% K-12的ORFs序列没有在志贺氏菌的基因组中被检测出, 而志贺氏菌的基因组中包含至少2800个保守的ORFs, 组成了其共有的"共有骨架". 进一步分析提示, 这些"共有骨架"是维持肠道细菌正常生命生理活动所必需的基本组成. 此外, 只有20%的Sf301特异性ORFs同时存在于其他3个菌株中, 揭示了各菌株间基因组的异质性和菌属内的遗传多样性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	金奇		19	225	7.0	14.0
2	刘红	山东大学微生物技术国家重点实验室	42	162	7.0	11.0
3	彭俊平		4	29	3.0	4.0
4	杨剑		3	18	3.0	3.0
5	孙立连		4	14	2.0	3.0
6	陈淑霞		2	12	1.0	2.0