间隔臂和探针长度与寡核苷酸芯片重复性相关性研究

• 作者: 潘继红 韩金祥
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 寡核苷酸芯片 杂交重复性 变异系数
• 年，卷（期）: 2003,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 12-15
• 页数: 4页
• 分类号: Q52
• 字数: 1860字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2003.01.004

摘要

研究寡核苷酸芯片的重复性与间隔臂(spacer)和探针长度之间的相关性.设计12条不同长度的带有不同spacer的探针,与749 bp荧光标记靶序列杂交.扫描分析三次杂交结果,用Quantarray定量分析软件进行分析.随探针长度的延长,杂交信号的变异系数逐步降低.15mer的探针杂交的信号较弱,杂交不够稳定,重复性也相对较差.20mer、25mer、30mer的探针的变异系数逐渐降低.spacer为15时变异系数最小.说明选择spacer为poly(dT)15的25mer和30mer的探针可以获得较好的重复性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩金祥	山东省医药生物技术研究中心国家卫生部生物技术药物重点实验室	212	1027	15.0	22.0
2	潘继红	山东省医药生物技术研究中心国家卫生部生物技术药物重点实验室	22	157	8.0	11.0