SARS病毒基因组所编码的E蛋白的二级结构和B细胞表位预测

• 作者: 万瑛 吕燕波 吴玉章
• 来源期刊: 免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: SARS病毒 E蛋白 B细胞表位 二级结构 预测
• 年，卷（期）: 2003,（6）
• 所属期刊栏目: SARS专题
• 页码范围: 407-410
• 页数: 4页
• 分类号: R392.11
• 字数: 1654字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-8861.2003.06.001

摘要

目的预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位和二级结构.方法以SARS病毒基因组序列为基础,采用Gar-nier-Robson方法、Chou-Fasman方法和Karplus-Schultz方法预测E蛋白质的二级结构;用Kyte-Doolittle方案预测蛋白质的亲水性;用Emini方案预测蛋白质的表面可能性;用Jmeson-Wolf方案预测氨基酸的抗原性指数.综合评判,预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位.结果在SARS病毒E蛋白N-端的第1～6、13～19、39～43、47～64区段和第73～76区段有β-折叠中心;第6～12区段和第67～69区段可能形成转角或无规则卷曲,是柔性区域.E蛋白N端第2～13区段和第61～74区段为B细胞优势表位区域.结论用多参数预测SARS病毒E蛋白的二级结构和B细胞表位,为实验方法探索SARS冠状病毒E蛋白的B细胞表位提供理论依据.