拟南芥基因密码子偏爱性分析

• 作者: 单丽伟 胡小平 范三红 郭蔼光
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟南芥 密码子偏爱性 XML
• 年，卷（期）: 2003,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 221-225
• 页数: 5页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 1646字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3282.2003.02.012

摘要

密码子偏爱性对外源基因的表达强度有一定影响,特别是编码蛋白质N端7～8个氨基酸残基的密码子.通过对拟南芥染色体中26 827个蛋白质对应的基因密码子进行分析,得到了编码氨基酸的61种密码子在拟南芥中的使用频率,并与大肠杆菌和哺乳动物进行了比较,结果表明三者间的密码子偏爱性有较大差异.这一分析结果对于动物基因在植物中的表达,及植物基因在微生物中的表达具有一定指导意义.同时提供了一种直接以XML文档为数据源解析巨型XML格式染色体数据的方法.