中国猪瘟兔化弱毒(脾淋毒)基因组 5′-UTR的克隆和二级结构分析

• 作者: 刘在新 刘湘涛 季建莉 张彦明 张显升 胡建和 谢庆阁 韩雪清
• 来源期刊: 西北农林科技大学学报(自然科学版)
• 学科: 农学
• 关键词: 猪瘟 中国猪瘟兔化弱毒 5′-UTR 克隆 序列及二级结构分析
• 年，卷（期）: 2003,（1）
• 页码范围: 105-108
• 页数: 4页
• 分类号: S8582.65+1
• 字数: 2726字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1671-9387.2003.01.022

摘要

据已发表的CSFV C-株序列,设计合成了5′-UTR特异性PCR引物对P1-N1及半套式下游引物N1′.从兔脾组织中提取总RNA,应用RT-PCR及Half-nested PCR成功地扩增出了CSFV 5′-UTR,进一步将该片段克隆到pMD-18T载体质粒并进行了序列测定.与Shimen株、ALD株、GPE-株、Holland C-株和Russian C-株相应区段的比较分析表明,其同源性分别为96.2%,95.7%,96.0%,98.7%和95.4%.5′-UTR中发现的隐性AUG起始密码子及茎环二级结构,可能在多聚蛋白前体的翻译以及病毒的复制中起着重要作用.