钩端螺旋体血小板激活因子乙酰水解酶基因特征分析

• 作者: 吴春福 张怡轩 缪有刚 茅翔 赵国屏 郭晓奎
• 来源期刊: 中国人兽共患病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 钩端螺旋体 血小板激活因子乙酰化酶 出血 生物信息学
• 年，卷（期）: 2003,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 17-21
• 页数: 5页
• 分类号: R377+.5
• 字数: 4358字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2003.03.003

摘要

目的由于钩端螺旋体病的主要特征之一是组织器官广泛性出血,出血部位发生在黏膜、脏器、浆膜和皮肤等处,严重者出现大面积肺弥散性出血、咳血,是危重钩端螺旋体病早期最常见的死因,其致病机理仍不清楚.本文使用生物信息学软件分析钩端螺旋体基因LA2144(血小板激活因子乙酰化酶,PafAH)所编码蛋白的结构和功能,并探讨其在致病过程中的作用.方法使用NCBI,Swissprot/TrEMBL,ProDom,Pfam,Jpred2,SWISS-MODEL,TMpred,SignalP,ClustW对问号钩端螺旋体黄疸出血型赖株全基因组ORF基因诠释,编码蛋白进行在线分析,并使用Bioedit软件进行氨基酸同源性比较分析.结果确定了问号钩端螺旋体黄疸出血型赖株血小板激活因子乙酰化酶基因,该基因编码蛋白质与哺乳动物pafAH在一级结构上相似性达42%,以牛脑pafAH(Ib)γ亚基(1WAB/PDB)为模件模拟该蛋白三级结构,发现两者立体结构与非常相似,催化位点完全相同,均由Ser-His-Asp组成催化三合体.结论该基因可能与钩体染色体所编码的胶原酶基因,溶菌酶基因,YopM基因,VwA基因协同在钩端螺旋体病出血过程中起作用,最终导致弥散性出血和咳血.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭晓奎	上海第二医科大学病原生物学教研室	43	241	8.0	13.0
2	赵国屏	中国科学院上海生命科学院	52	207	7.0	11.0
4	吴春福		130	1452	22.0	33.0
7	缪有刚	中国科学院上海生命科学院	7	82	4.0	7.0
8	茅翔	中国科学院上海生命科学院	5	5	1.0	2.0
9	张怡轩	中国科学院上海生命科学院	5	32	4.0	5.0