SARS相关病毒(BJ01株)的全序列及其比较分析

• 作者: 于曼 刘伯华 刘洪 司炳银 吕富双 姜涛 常国辉 张雨 彭文明 曹务春 李晓萸 李豫川 杨保安 杨瑞馥 汪建AASpli 王翠娥 甘永华 祝庆余 秦鄂德 范宝昌 谭刚 邓永强
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 医学
• 关键词: 严重急性呼吸综合征(SARS) 冠状病毒 基因组 系统发生学 突变
• 年，卷（期）: 2003,（11）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1127-1134
• 页数: 8页
• 分类号: R37
• 字数: 8534字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074X.2003.11.003

摘要

严重急性呼吸综合征(SARS)是一种新发现的急性传染病.对一株已确认为SARS病原体的冠状病毒(BJ01)进行了全基因组序列测定,并与其他已知病毒进行了比较分析.该病毒基因组全长为29.725 kb,含11个可读框(ORFs),由1个稳定区和1个可变区组成,其中稳定区编码RNA依赖性RNA聚合酶,包括两个ORFs;可变区含有4个蛋白质编码序列(CDSs),分别编码病毒的4个结构蛋白(S,E,M,N蛋白).此外,可变区还包括5个非典型的预测蛋白(PUPs).此病毒基因的排列顺序与其他已知的冠状病毒一致.通过与已知RNA病毒的序列比对, 可以确认该病毒属于冠状病毒科(Coronaviridae).与GenBank中已知的5个SARS相关病毒全基因组序列的比较分析显示, 已在30个核苷酸位置上检出序列差异,总体突变率为0.1%,其中15个变异位点在编码区,可能会导致蛋白质的氨基酸改变(异义突变).S蛋白中已发现3处可能引起该蛋白质物化特征变化的变异,而该蛋白质可能参与病毒与宿主间的免疫反应.与病毒包膜形成相关的M蛋白中则已发现两处氨基酸变化.进化分析表明,SARS病毒可能不是来源于人类,但没有证据证明是人为制造的.为了阐明SARS相关病毒的病因学以及排除其他可能的SARS病原体的存在,仍需进行更深入的研究.