用于SARS冠状病毒检测的60 mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用

• 作者: 吴清华 宋艳斌 张宝 王艳 石嵘 肖维威 郑文岭 郭秋野 马文丽
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 医学
• 关键词: SARS冠状病毒 寡核苷酸基因芯片 RD-PCR 荧光标记 分子杂交
• 年，卷（期）: 2003,（12）
• 所属期刊栏目: 专题：SARS冠状病毒研究
• 页码范围: 1237-1241
• 页数: 5页
• 分类号: R37
• 字数: 5111字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074X.2003.12.001

摘要

设计并应用60 mer寡核苷酸基因芯片实现对SARS冠状病毒的检测.根据寡核苷酸基因芯片的原则设计出30条60 mer的寡核苷酸片段, 覆盖SARS冠状病毒(以最先提交全序列的TOR2株作为参考, GenBank登录号: AY274119)全基因组, 点样制备成12×12的寡核苷酸基因芯片, 从临床诊断SARS患者痰液标本抽提病毒RNA, 采用限制性显示技术进行标记, 将标记好的样品与芯片杂交, 洗脱, 扫描.初步探索寡核苷酸芯片诊断SARS冠状病毒的可行性.杂交结果表明, 来自SARS患者样品与芯片上的多个SARS探针杂交, 出现了明显的荧光信号; 阴性和空白对照探针上没有杂交信号, 而对照样品仅与3个SARS探针有杂交.由此可知, 采用60 mer寡核苷酸基因芯片可以从基因水平实现对SARS冠状病毒多段序列的平行检测, 对于提高检出率有一定意义, 此外, 尚可用于监测在发病过程的各个阶段中病毒基因的活动状况.