基因芯片在中国南方汉族人白细胞抗原-DRB分型中的应用

• 作者: 丁言德 康敏华 方燕红 李成涛 李瑶 沈瑾 肖家全 谭建明
• 来源期刊: 中华医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 人白细胞抗原 基因分型 移植 基因芯片
• 年，卷（期）: 2003,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 417-420
• 页数: 4页
• 分类号: R55
• 字数: 3064字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0376-2491.2003.05.016

摘要

目的建立一种用于HLA-DRB分型的基因芯片,并通过与PCR-SSP比较,评价芯片的性能.方法根据中国汉族南方人常见的HLA-DRB位点基因及其多态性的独特序列,在第二外显子区域设计特异性的寡核苷酸分型探针,将其点在玻片上,制成芯片.基因组DNA通过组间特异引物扩增,扩增中同时用荧光素Cy5标记.扩增标记后的产物与结合在芯片上的探针进行杂交,通过荧光扫描仪对杂交产生的荧光信号值进行分析,确定样品的HLA-DRB基因亚型.将这一方法应用于110份样本的HLA-DRB基因分型并与PCR-SSP分型的结果进行比较.结果110份淋巴细胞样本,除1份PCR无产物致芯片不能分型外,其余样本芯片分型全部成功.不吻合样本10份:其中SSP定型纯合子6份,芯片分型全部为杂合子,SSP定型为杂合子1份,芯片结果为纯合.经第三方用PCR-SSO验证,证实芯片分型正确.另外3份不吻合的样本经测序,证实SSP分型错误2份,芯片分型错误1份.芯片的重复率为95%.结论基因芯片是一种理想的分型方法,具有特异性高、重复性好、操作简便、所需样本量少、结果判读容易、一次可作多份样本的优点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李成涛	上海联合基因科技集团、博星芯片研究所	4	13	1.0	3.0
2	康敏华	上海联合基因科技集团、博星芯片研究所	3	12	1.0	3.0
3	李瑶	上海联合基因科技集团、博星芯片研究所	6	24	3.0	4.0
4	方燕红	上海联合基因科技集团、博星芯片研究所	2	12	1.0	2.0