SARS冠状病毒检测60 mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用

• 作者: 吴清华 宋艳斌 张宝 王艳 石嵘 肖维威 郑文岭 郭秋野 马文丽
• 来源期刊: 广东医学
• 学科: 医学
• 关键词: SARS冠状病毒 寡核苷酸基因芯片 RD-PCR 荧光标记 分子杂交
• 年，卷（期）: 2003,（z1）
• 所属期刊栏目: 病原学专题
• 页码范围: 14-17
• 页数: 4页
• 分类号: R511
• 字数: 4443字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-9448.2003.z1.005

摘要

目的设计并应用60 mer寡核苷酸基因芯片实现对SARS冠状病毒的检测.方法根据寡核苷酸基因芯片的设计原则设计出30条60 mer的寡核苷酸片段,覆盖SARS冠状病毒(以TOR2株为参考序列,GENEBANK索取号:AY274119)全基因组,点样制备成12×12的寡核苷酸基因芯片,将临床诊断SARS患者痰液标本抽提病毒RNA,采用限制性显示技术进行标记,将标记好的样品与芯片杂交,洗脱,扫描.初步探索寡核苷酸芯片诊断SARS冠状病毒的敏感性及特异性,并对芯片做进一步的优化.结果来自SARS患者样品与芯片上的多个SARS探针杂交,出现了明显的荧光信号;阴性和空白对照探针上没有杂交信号,而对照样品仅与一个SARS探针有杂交.结论采用60 mer寡核苷酸基因芯片可以从基因水平实现对SARS冠状病毒多段序列的平行检测,对于提高检出率有一定意义,此外,尚可用于监测在发病过程的各个阶段中病毒基因的活动状况.