中华鳖五群体遗传变异的RAPD分析

• 作者: 刘至治 李思发 蔡完其
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中华鳖 群体 遗传变异 随机扩增多态DNA
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 页码范围: 119-126
• 页数: 8页
• 分类号: S917
• 字数: 5454字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2004.02.002

摘要

从97个10碱基随机引物中筛选出30个多态性引物,对黄河鳖、淮河鳖、洞庭湖鳖、鄱阳湖鳖及太湖鳖5个群体共100只个体进行RAPD分析.结果表明,中华鳖的遗传多样性较丰富.表现在:(1)在获得的341条RAPD扩增带中,有234条(68.6%)呈现多态性;2个引物有可明显地反映种群差异的扩增带,其中S105扩增的1408bp在黄河鳖的出现频率仅为20%,而在另外4个群体的出现频率达80%～90%;S37扩增的438bp在5个群体的出现频率大小为:黄河鳖85% >淮河鳖65% >洞庭湖鳖55% >鄱阳湖鳖40% >太湖鳖20%,呈现出从黄河到淮河到长江、从长江的中游到下游逐步降低的遗传渐变现象;(2)多态位点比例(P)的大小顺序为:太湖鳖59.25%>洞庭湖鳖56.52%>鄱阳湖鳖55.80%>淮河鳖55.03%>黄河鳖54.43%,但5个群体间的差异不显著(F=0.644<F0.05;4,145=2.45);5群体内的遗传多态度(π)在0.3644～0.3883间;(3)群体内遗传相似度大小顺序为:淮河鳖0.782>黄河鳖0.771>鄱阳湖鳖0.768>洞庭湖鳖0.750>太湖鳖0.722,其中太湖鳖与黄河鳖、淮河鳖、鄱阳湖鳖3个群体间的差异显著(P <0.05);(4)分子方差分析(AMOVA)表明,黄河鳖与淮河鳖、洞庭湖鳖及鄱阳湖鳖3个群体间,太湖鳖与黄河鳖、淮河鳖2个群体间有极显著的遗传分化(P<0.001);(5)根据遗传距离,用UPGMA 和NJ法进行聚类分析表明:黄河鳖与淮河鳖、洞庭湖鳖与鄱阳湖鳖分别先聚在一起,最后再与太湖鳖聚类,显示太湖鳖在基因组上与其它4个群体鳖存在明显歧化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李思发	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	78	1770	26.0	39.0
2	蔡完其	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	30	970	18.0	30.0
3	刘至治	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	7	215	7.0	7.0