中国HCV5'-非编码区复合酶切分型及其3b基因型序列分析

• 作者: 孙南雄 尤鹏 张永祥 杜绍财 范晓峰 邱国华 魏来
• 来源期刊: 中华检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: C型肝炎样病毒属 基因型 聚合酶链反应
• 年，卷（期）: 2004,（10）
• 所属期刊栏目: 基础实验诊断研究
• 页码范围: 683-686
• 页数: 4页
• 分类号: R4
• 字数: 2547字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:1009-9158.2004.10.020

摘要

目的研究中国丙型肝炎病毒(HCV)不同基因型感染分布情况,并对3b序列进行分析. 方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT -PCR)技术扩增HCV5'NCR 1a、1b、2a、2b、3a、3b、4a、6a不同基因型的cDNA及187份HCV RNA阳性样品中cDNA.A应用BHH (BsrB I、HaeⅡ、Hinf I)复合内切酶消化5′-NCR cDNA,B应用BstUⅠ消化,C应用HaeⅢ消化,电泳检测片段大小.结果 187例HCV RNA阳性患者A B C分型结果表明,1b型感染率占67.38%,2a型12.30%,1b/2a 型为5.88%,3b型 5.35%,2b型3.21%,2a/2b、1b/2b型各为2.14%,1a型1.07,6a型0.54%.3份3b基因型5'-NCR A-T克隆测序结果表明,3株3b型之间同源性为99.54%～100%.其中chiKQ50与GI514395 3a株为96.28%与GI676877 3b株同源性为98.6%,与1a型为93.49%,与1b型为94.88%,与2a型为91.63%,与2b型为89.30%,与4a型为95.35%,与6a型为93.4%,结论研究结果表明该项分型技术既保证了RT- PCR检测灵敏度,又具有良好的分型效果.提示:该分型方法不仅适合中国HCV基因型检测,对亚洲及欧洲和非洲HCV分型研究也具有一定的参考价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏来	北京大学人民医院肝病研究所	209	1397	18.0	26.0
2	杜绍财	北京大学人民医院肝病研究所	37	155	8.0	10.0
3	邱国华	北京大学人民医院肝病研究所	6	70	5.0	6.0
4	尤鹏	北京大学人民医院肝病研究所	25	141	7.0	10.0
5	孙南雄	南京医科大学第一附属医院传染病研究室	22	217	9.0	14.0
6	张永祥	南京医科大学第一附属医院传染病研究室	38	286	10.0	15.0
7	范晓峰	美国Saint Louis大学内科学胃肠与肝病科病毒性肝炎研究中心	2	36	2.0	2.0