茶树新梢cDNA文库的构建和ESTs测序成功率初步分析

• 作者: 赵丽萍 陈亮 高其康
• 来源期刊: 茶叶科学
• 学科: 农学
• 关键词: 茶学 茶树[Camellia sinensis(L.)O.Kuntze],新梢,mRNA,cDNA文库,EST,测序
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 18-22
• 页数: 5页
• 分类号: S571.1|Q523
• 字数: 3604字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-369X.2004.01.003

摘要

报道了国内第一个茶树cDNA文库的构建及其EST测序成功率分析.以Trizol一步法从龙井43春茶新梢中提取总RNA,分离纯化富含Poly(A)的mRNA,LD-PCR反转录合成双链cDNA,以λTripEX2为载体,构建了龙井43新梢cDNA文库.以XLl-Blue为受体菌测定原始文库的滴度为6.8×105 pfu/ml,总克隆数为3.5×105个,重组率为98.05%,扩增后文库总滴度为7.2×109 pfu/ml.对随机挑取的噬菌斑进行PCR鉴定,表明插入片段大多分布在0.5-2.0kb之间,绝大部分在1.0-1.5kb左右.文库质量鉴定结果表明,构建的茶树新梢cDNA文库具有较好的库容量、较高的重组率以及较大的插入片段.对4320个克隆的序列测定表明,获得有用序列2963个,测序成功率为68.5%,剔除短序列后,首批共获得1687个茶树ESTs.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈亮	中国农业科学院茶叶研究所农业部茶叶化学工程重点实验室	108	1896	22.0	41.0
2	高其康	浙江大学分析测试中心生物大分子研究室	41	425	12.0	19.0
3	赵丽萍	中国农业科学院茶叶研究所农业部茶叶化学工程重点实验室	9	153	7.0	9.0