多样性指标用于基因中剪切位点的识别

• 作者: 张利绒 罗辽复
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 剪切位点 多样性增量 二次判别法 外显子 内含子
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 77-82
• 页数: 6页
• 分类号: Q61
• 字数: 4300字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3282.2004.01.011

摘要

根据基因剪切位点处的碱基保守性特征,和附近位点的碱基组成和关联特征,应用多样性指标和二次判别分析,对几类模式生物的基因结构进行统一的分析和预测,能够较好地识别外显子和内含子及其边界.计算结果表明,对于4类物种,线虫(C.elegans),拟南芥(A.thaliana), 果蝇(D.melanogaster)和人类(human),核苷酸水平的识别精度为92.5%～97.1%,外显子水平的识别敏感性为83.7%～94.5%,特异性为87.8%～97.1%.预测能力优于GeneSplicer等剪切位点检测软件.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗辽复	内蒙古大学物理系	101	476	12.0	17.0
2	张利绒	内蒙古大学物理系	28	69	6.0	7.0