鸡传染性支气管炎中国地方分离毒株LX4mRNA1ORF1的遗传变异特征

• 作者: 刘玉芬 刘胜旺 孔宪刚 邵昱昊
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 农学
• 关键词: 冠状病毒 鸡传染性支气管炎 mRNA1ORF1基因 遗传变异
• 年，卷（期）: 2004,（4）
• 所属期刊栏目: 人与动物病毒
• 页码范围: 347-352
• 页数: 6页
• 分类号: S858.31|S852.659.6
• 字数: 4105字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2004.04.010

摘要

应用RT-PCR方法扩增了冠状病毒鸡传染性支气管炎中国分离毒株LX4的mRNA1 ORF1,并将其进行了克隆、序列测定和分析.表明LX4mRNA1基因包含2个ORF,其中ORF1a由11 916个核苷酸组成,编码一条3 971个氨基酸残基组成的多肽.ORF1b由7 950个核苷酸组成,编码2 649个氨基酸残基组成的多肽.与美国Beaudette株对应的ORF1a核苷酸及推导的氨基酸序列同源性均为85%,与对应的ORF1b的同源性分别为89%和95%.二者ORF1a和ORF1b重叠区推测的"滑脱序列"(slippery sequence)核苷酸序列一致,"假结"(pseudoknot)基本结构相似.不同之处在于"假结"第2环中LX4的第7位为A,而Beaudette株在该位置为G.与Beaudette株比较,LX4 ORF1a核苷酸变异最频繁的区域集中在第2 656～3 098位碱基处,且在该区域有60个碱基的插入,导致推导的氨基酸序列插入了20个氨基酸残基.LX4 ORF1b序列缺失9个核苷酸,主要集中在第5 168～5 181位之间,导致对应的氨基酸缺失3个.但这些差异是否与病毒的生物学特性有关不明.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘玉芬	东北农业大学动物医学院	9	153	6.0	9.0
2	孔宪刚		6	114	4.0	6.0
3	刘胜旺		5	75	4.0	5.0
4	邵昱昊		1	5	1.0	1.0