我国分离的肠道病毒71型(SHZH03病毒株)全基因组核苷酸序列分析

• 作者: 何雅青 周世力 喻子牛 李琳琳 杨洪 金奇
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道病毒71型 核苷酸序列分析 同源性分析
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 所属期刊栏目: 人与动物病毒
• 页码范围: 7-11
• 页数: 5页
• 分类号: R373.2
• 字数: 3316字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2004.01.002

摘要

对肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)中国(深圳)分离株SHZH03进行了全基因组(未包括多聚腺苷尾)7406个碱基的核苷酸序列测定.结果表明,SHZH03株与其它肠道病毒71型毒株相比,在编码区没有核苷酸的缺失和插入,其5′UTR和3′UTR区的长度和序列有一定的差异.核苷酸同源性比较结果表明,在P1区SHZH03株与SHZH98株、中国台湾流行株(TW2086、TW2272)的同源性较高(分别为92.5%,90.1%和87.9%),与新加坡流行株SIN5666、SIN5865及标准株MS、BrCr的同源性则在81%左右,而与Coxsackievirus A16(Cox.A16)的同源性最低(63.6%).氨基酸同源性比较结果表明,在P1区SHZH03株与Cox. A16的同源性最低,但在P2和P3区SHZH03株与Cox.A16的同源性最高.P1区的遗传进化分析表明,SHZH03株和中国台湾1998年流行的EV71毒株的亲缘关系较近,属于同一型(genogroup),而与标准株BrCr和MS的亲缘关系较远.上述结果有助于肠道病毒71型的基础研究和中国对于EV71所致疾病的预防.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	喻子牛	华中农业大学生命科学技术学院	134	1829	21.0	35.0
2	周世力	华中农业大学生命科学技术学院	1	51	1.0	1.0
6	李琳琳	中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室	5	109	5.0	5.0
7	何雅青	中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室	1	51	1.0	1.0
8	杨洪	中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室	1	51	1.0	1.0
9	金奇	中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室	10	220	5.0	10.0