分枝杆菌菌种鉴定DNA微阵列的初步研究与应用

• 作者: 吴雪琼 庞劲松 张亮 张俊仙 张广宇 张琼 李洪敏 梁建琴 陆阳 雷红
• 来源期刊: 中国抗生素杂志
• 关键词: DNA微阵列 菌种鉴定 分枝杆菌 聚合酶链反应
• 年，卷（期）: 2004,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 746-751
• 页数: 6页
• 分类号: R378
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-8689.2004.12.007

摘要

目的制备快速鉴定分枝杆菌菌种的DNA微阵列.方法根据19种分枝杆菌标准株的16S RNA序列设计寡核苷酸探针,制备DNA微阵列,通过反向杂交技术鉴定19种分枝杆菌标准株、9种非分枝杆菌标准株和31株分枝杆菌临床分离株带荧光标记的PCR产物.结果该DNA微阵列与9种非分枝杆菌标准株不杂交,具有分枝杆菌特异性;可将19种分枝杆菌标准株鉴定到群或种,具有较高的分枝杆菌种特异性.应用PCR-SSCP分枝杆菌初步菌种鉴定方法对31株分枝杆菌临床分离株进行初步的鉴定,9株为结核分枝杆菌复合群和22株为非结核分枝杆菌.应用DNA微阵列进一步进行菌种鉴定,9株与探针a杂交阳性,为结核分枝杆菌复合群;2株与探针c杂交阳性,为胞内分枝杆菌;8株与探针d杂交阳性,为堪萨斯分枝杆菌或瘰疬分枝杆菌或猿猴分枝杆菌或胃分枝杆菌;1株与探针k杂交阳性,为戈登分枝杆菌;2株与探针p杂交阳性,为龟分枝杆菌脓肿亚种;2株与探针r杂交阳性,为偶然分枝杆菌;1株与探针s杂交阳性,为草分枝杆菌;2株与探针a和p杂交阳性,为结核分枝杆菌和龟分枝杆菌脓肿亚种复合感染株;1株与探针a和r杂交阳性,为结核分枝杆菌和偶然分枝杆菌复合感染株;3株与该芯片杂交阴性.2株临床分离株经基因测序也证实DNA微阵列鉴定的特异性.结论该DNA微阵列有可能简便、快速、准确地鉴定大多数分枝杆菌菌种.