扬子鳄MHCⅡ类B基因第二外元的克隆及序列分析

• 作者: 史燕 吴孝兵 晏鹏 陈壁辉
• 来源期刊: 动物学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 扬子鳄 MHC Ⅱ类B基因第二外元 序列分析
• 年，卷（期）: 2004,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 415-421
• 页数: 7页
• 分类号: Q959.64
• 字数: 3134字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0254-5853.2004.05.008

摘要

3头扬子鳄血样取自宣城安徽省扬子鳄繁殖研究中心.利用一对简并引物对MHC Ⅱ类B基因第二外元的部分片段进行扩增;通过克隆、单链构象多态性分析、测序,并将测得序列与下载的8个物种MHC序列比对,确定序列差异和变异位点;利用MEGA软件构建NJ树,PAUP4.0构建MP树.结果得到10种不同的序列,片段长166bp.核苷酸序列中有38个变异位点,氨基酸序列中有23个变异位点;推定的抗原结合位点非同义替换(dN)明显高于同义替换(dS).10种序列的NJ树和MP树极为相似,均为A、B两个分支,两个分支明显的特异性位点核苷酸序列中有9个,氨基酸序列中有7个.表明扬子鳄MHC Ⅱ类B基因第二外元有较高的多态性,有利于扬子鳄饲养种群的遗传保护.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴孝兵		5	39	3.0	5.0
2	晏鹏		3	26	2.0	3.0
3	史燕		1	19	1.0	1.0
4	陈壁辉		1	19	1.0	1.0