亲缘生物法生物信息技术在水产基因研究中的应用

• 作者: 严霞 唐冬生 张细权 李芳
• 来源期刊: 水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 生物信息学 亲缘生物法 水产 鳜鱼 rRNA基因
• 年，卷（期）: 2004,（8）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 24-26
• 页数: 3页
• 分类号: S966.12
• 字数: 3714字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-1111.2004.08.008

摘要

用Entrez、SRS等检索工具可从GenBank、EMBL等核酸序列数据库、鱼类专业数据库获取相关水产动物的基因等信息,通过电子邮件或网页填表等方式用BLAST、FASTA等序列分析软件来分析获得的信息,以鳜鱼rRNA基因为例,根据鳜鱼的分类树,按种、属、科、亚目、目、总目追级向上寻找亲缘关系较近的其它鱼类的rRNA基因,直到找到有价值的rRNA基因序列.将有价值的rRNA基因序列拼接成重叠群,根据重叠群设计引物、克隆鳜鱼的rRNA基因,获得鳜鱼的3个rRNA基因及其间隔序列.为经济动物的基因研究建立了一种亲缘生物法的生物信息学技术.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张细权	华南农业大学动物科学学院	109	1363	19.0	31.0
2	唐冬生	佛山大学生命科学学院	13	104	5.0	10.0
3	严霞	华南农业大学动物科学学院	2	9	2.0	2.0
4	李芳	佛山大学生命科学学院	4	22	2.0	4.0