阴沟肠杆菌B8拮抗活性相关基因的克隆与分析

• 作者: 何世成 余旭平 姚学萍 朱军莉 李德葆 陈卫良 黄海宁
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 阴沟肠杆菌B8 拮抗机理 anrF基因 andrimid生物合成基因簇
• 年，卷（期）: 2004,（12）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1139-1144
• 页数: 6页
• 分类号: Q7
• 字数: 6520字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074X.2004.12.005

摘要

为研究具有广谱拮抗活性的阴沟肠杆菌B8的拮抗机理,应用自杀性质粒pZJ25,将Tn5转座到B8的染色体上,筛选到2株拮抗活性丧失的菌株.选择其中B8F突变株,应用Tn5上的Kanr基因作为标签,对Tn5插入位点右侧的拮抗活性相关基因片段进行了克隆,筛选得到质粒pTLF,经亚克隆后测序,获得F片段735 bp的序列.提取原始菌株B8基因组DNA,酶切后与Pst Ⅰ接头连接,应用接头引物和根据F片段设计的特异引物,在F片段的左右两侧进行染色体步行,获得了F片段(Tn5插入位点)左侧的1106 bp序列和F片段右侧的664 bp序列.生物信息学分析显示,获得的B8菌株拮抗相关基因序列包含3个ORF,与Pantoea agglomerans的andrimid生物合成基因簇(基因GenBank登录号AY192157)有较高的同源性,分别对应于admM,admN和admO共3个基因.被Tn5插入破坏的ORF(命名为anrF基因)对应于admM(Polyketide合酶基因),插入位点位于终止密码前214 bp处.由此证明,anrF基因与B8菌株的拮抗活性相关,推测B8菌株产生的拮抗物质为andrimid.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈卫良	浙江大学生物技术研究所	24	431	9.0	20.0
2	余旭平	浙江大学动物科学学院	67	501	12.0	18.0
6	李德葆	浙江大学生物技术研究所	76	2052	28.0	43.0
7	姚学萍	甘肃农业大学动物科学学院	5	8	2.0	2.0
8	朱军莉	浙江大学动物科学学院	10	90	5.0	9.0
9	黄海宁	浙江大学生物技术研究所	2	5	2.0	2.0
10	何世成	浙江大学动物科学学院	9	92	4.0	9.0