罗氏沼虾诺达病毒的核酸检测及其部分序列分析

• 作者: Bonami Jean-Robert Sri Widada Joannes 汤显春 石正丽 解云礼
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 农学
• 关键词: 罗氏沼虾 诺达病毒 点杂交 RT-PCR 序列分析
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 所属期刊栏目: 人与动物病毒
• 页码范围: 62-66
• 页数: 5页
• 分类号: SP45.4
• 字数: 3641字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2004.01.012

摘要

根据安替列群岛分离的罗氏沼虾诺达病毒株基因组序列(MrNV-ant),制备特异性核酸探针,设计特异性引物,用点杂交和RT-PCR的方法检测在中国境内分离的罗氏沼虾诺达病毒(MrNV-chin).点杂交的方法可以检测出少于26ng的患肌肉白浊症的组织样品中的病毒,或少于25ng的病毒RNA样品;RT-PCR可以检测出少于25pg的RNA样品.扩增的MrNV-chin RNA1序列长858个核苷酸,与MrNV-ant的核苷酸一致率为957%,两者翻译后的氨基酸序列的一致率为99.7%.扩增的MrNV-chin RNA 2序列长1121个核苷酸,与MrNV-ant的核苷酸一致率为92%,两者翻译后的氨基酸序列的一致率为93.2%.因此,MrNV-ant和MrNV-chin应属于同一种病毒的不同分离株.用两株罗氏沼虾诺达病毒的RNA聚合酶序列与其它6株诺达病毒RNA聚合酶序列比较后构建的进化树中,罗氏沼虾诺达病毒与Alphanodavirus的亲缘关系近于与Betanodavirus的亲缘,组成了一个新的分支.