基因表达谱芯片技术筛选NS5A-TP4蛋白反式调节基因

• 作者: 刘妍 张树林 成军 杨倩 洪源 王建军
• 来源期刊: 世界华人消化杂志
• 学科: 医学
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 病毒性肝炎
• 页码范围: 311-314
• 页数: 4页
• 分类号: R5
• 字数: 5272字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-3079.2004.02.014

摘要

目的:对新基因NS5A-TP4转染肝癌细胞的基因表达谱进行分析,探索该基因表达对肝细胞基因表达的调节机制及其生物学功能.方法:应用生物信息学(bioinformatics)技术,分析我室通过抑制性消减杂交技术筛选得到的新基因NS5A-TP4的全长编码序列,并NS 5A-TP4构建基因的真核表达载体pcDNA3.1(-)-NS5A-TP4.应用基因表达谱芯片技术对重组表达质粒pcDNA3.1(-)-NS5A-TP4转染的HepG2细胞和空载体处理的相同细胞差异表达的mRNA进行检测.结果:确定基因NS5A-TP4由762 nt组成,编码253 aa的蛋白.基因表达谱芯片所检测的1152条目的基因均为GenBank中登录的基因,NS5A-TP4表达质粒转染的细胞有18条差异表达基因,其中12条基因表达增强,6条基因表达降低.这些差异表达的基因与细胞信号转导、凋亡、生长调节密切相关.结论:基因表达谱芯片技术可为初步探索新基因的功能提供重要的资料.本实验结果为进一步阐明NS5A-TP4生物学功能及HCV-NS5A的致病机制提供了理论依据.