芒果生长素反应因子类蛋白的cDNA克隆和表达

• 作者: 李筱菊 肖洁凝 黄学林 黄霞
• 来源期刊: 生物工程学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 芒果(Mangifera indica L.)子叶 不定根形成 生长素反应因子基因 (ARF) cDNA克隆
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 所属期刊栏目: 基因工程
• 页码范围: 59-62
• 页数: 4页
• 分类号: Q943
• 字数: 2686字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3061.2004.01.013

摘要

通过SSH法获得了一个与不定根形成相关的差异表达的cDNA片段,其推导的氨基酸序列与拟南芥的生长素反应因子(ARF)类蛋白具有较大的同源性,因此将它命名为MiARF.用所设计的基因特异引物进行3′RACE扩增获得包含完整读码框架(ORF)的MiARF1(GenBank登录号为AY255705)和MiARF2(GenBank登录号为AY300808).MiARF1全长为3272bp,其中,ORF含2523bp,5′非翻译区(5′UTR)含285bp, 3′非翻译区(3′UTR)含464bp.由该序列所推导的氨基酸序列与拟南芥ARF2(BAB10162)的ID值为64%, E值为0,在DNA结合区域(DBD)、III和IV区域的同源性更高,ID值均大于80%. MiARF2 cDNA全长为1474bp,其中ORF含981bp,5′非翻译区含285bp, 3′非翻译区含208bp,由该序列所推导的氨基酸序列与拟南芥ARF2(BAB10162)的ID值为84%,E值为e-151. MiARF2仅具有DBD保守区并与MiARF1的基本相同,但缺乏III和IV区域.Virtural Northern 杂交表明:MiARF2在生根的组织中表达水平高, 而在非生根的组织中未见表达;MiARF1在生根及非生根的组织中均有表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖洁凝		5	120	4.0	5.0
5	黄学林		1	32	1.0	1.0
6	黄霞		1	32	1.0	1.0
7	李筱菊		1	32	1.0	1.0